「マイクロアレイ解析入門」講座のご案内

AffymetrixのGeneChipに代表されるマイクロアレイ技術は、研究ツールとしての有用性のみならず臨床診断、創薬標的遺伝子の同定などの臨床応用が最も期待されるツールであり、バイオ研究者やバイオ機器開発者にとって、その理解と解析手法の習得は必須といえます。

本講座は、マイクロアレイ技術およびその解析の基本からはじめ、マイクロアレイデータの前処理、有意な発現変動遺伝子の同定、時系列データのトレンド解析、クラスタ分析等の多変量解析による視覚化、機能情報による解析、疾患・サブタイプのクラス識別などを、実習を交えて実践的にわかりやすく解説します。

本講座は２日間の短期集中講座で、マイクロアレイによって得られたデータの解析手法を、パソコンを用いて演習する形式の講座となっております。実際にマイクロアレイを用いての実験等はございませんのでご注意下さい。

◆対象者◆

大学教養課程レベルの分子生物学の知識を有する方。
マイクロアレイに関する知識・実務経験をお持ちでない方もご参加いただけます。

◆本講座の特色◆

・マイクロアレイデータを解析ソフトウェアで解析してみたものの、この解析手法で適切なのかどうかがわからない
・解析してみたものの、用いた解析手法の原理についてはブラックボックスのままだ
・そもそも、なぜ、発現量について底を2とする対数をとるのだろうか？

といった疑問をおもちの方にうってつけなのが本講座です。少人数で丁寧にマイクロアレイ解析のイロハから最新の解析手法まで、その原理から実践的に解説します。

　また、本講座では、急増している時系列のデータについても最新の解析手法を解説します。
・時系列のデータは分散分析などの多群間での発現変動遺伝子の同定方法を適用すればいいのだろうか？
・時系列にわたって類似した発現変動のトレンドを示す遺伝子を同定するのには相関係数ではうまくゆかず困っている

といった悩みをおもちの方にもうってつけです。

◆日程◆

-1日目　08年1月25日（金）　13:00～17:30
（13:00～17:00 講義、17:00～17:30 質疑応答）

-2日目　08年1月26日（土）　10:00～15:00
（10:00～12:00,13:00～14:30 講義、14:30～15:00 質疑応答）

◆講義内容◆

■マイクロアレイ技術とマイクロアレイ解析の特徴
■マイクロアレイデータの誤差等
- 誤差, 実験計画, 繰り返し実験, 再現性 - FDA品質管理プロジェクト(MAQC)の報告
■マイクロアレイデータの前処理
- 品質管理 - 正規化など - R, Bioconductor入門 - R, Bioconductorによる解析実習
■有意な発現変動遺伝子の同定
- 倍率変化 - 二群間比較 - 多群間比較（組織間比較） - 多重検定の補正 - 並べ替え検定 - R, Bioconductorによる解析実習
■時系列データのトレンド解析
- 上昇・下降トレンドの同定　- ヨンクヒール検定 - 累積カイ2乗検定, 累積t法
- 任意のトレンドの同定
■多変量解析による視覚化
- クラスタ分析　- 階層的クラスタ分析 - k-meansクラスタ分析 - 距離, 類似度 - ヒートマップによる視覚化
- 主成分分析 (PCA)
- R, Bioconductorによる解析実習
■機能情報による解析
- Gene Ontology (GO)による機能注釈の取得
- 有意な発現変動を示すGOカテゴリの同定
- R, Bioconductorによる解析実習
■疾患・サブタイプのクラス識別
- サポートベクターマシン (SVM)
- R, Bioconductorによる解析実習

※当日は一部変更になる場合もございますので、ご了承下さい。

◆講師◆

荻島創一　先生

東京大学工学部計数工学科卒業。2005年東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科生命情報学博士課程修了。2005年4月から2006年3月東京医科歯科大学大学院システム情報生物学・生命情報学研究員を務め、2006年4月同特任助手、2007年４月から同助教。研究対象はシステム生物学、とくに発生システム。遺伝子発現データから転写上流配列の解析、細胞内システムのモデリングを行っている。著書に「バイオ研究が10倍はかどるMac OS X活用マニュアル」（共著、羊土社）。

◆会場◆

株式会社バイオサイエンスリンク会議室

◆受講料◆

\31,500（消費税込）　※2日間合わせての料金となります。

◆お申込方法◆ 　（ウェブ申込みはこちらから）

（1）	ウェブ上からオンラインお申込を承っております。　　＜オンライン申込へ＞ ※この申込ページはSSL（暗号化）対応によりお客様の情報を保護しております。 ※通信の状態などによりましては送信がエラーになる場合がございます。 3営業日以内に当社から何らかの返信がない場合、お手数ですがもう一度送信をお願い申し上げます。 ※ご記入頂いた個人情報は、当社の提供するサービス・セミナー等に関するご連絡、ご紹介の為にのみ利用致します。法律で認められた正当な理由なしに、無断で個人情報を第三者に開示することは致しません。

（2）	電子メールまたはFAXの場合、「お申込講座名、氏名、住所、電話番号、メールアドレス、所属（会社・学校等）、部署、役職」をご記入の上、弊社までお申し込み下さい。・電子メール：info@bs-link.com　　・FAX：03-3242-3852

（3）	お申込み後、入金方法をお知らせ致します。１週間以内にご入金下さい。受講料の入金をもって、正式のお申込みとさせて頂きます。

（4）	定員に達した際には、お申込を締め切らせて頂きますので、ご了承下さい。

◆注意事項◆

（1）	講座では、RやWekaの実習のため、パソコンを使用致します。LAN接続のため、「IPアドレスを自動的に取得する」設定のノートパソコンをご準備いただき、ご参加をお願いいたします。

（2）	本講座の受講をキャンセルされる場合には、お早めにご連絡下さい。講座開始日の前の週までに、キャンセルのご連絡を頂いた場合は、振込手数料を除き、残金を全額返却致します。上記期日以後のキャンセルの場合、キャンセル料は6,000円となります。また、講座開始日の当日にキャンセルのご連絡を頂いた場合は、受講料の返金は致しかねますのでご了承下さい。

◆お問い合わせ◆

株式会社バイオサイエンスリンク（担当：祐成）

〒103-0028　東京都中央区八重洲1-5-4　共同ビル（八重洲口）7F
Tel:03-3242-3851　 Fax:03-3242-3852　e-mail: info@bs-link.com